明日香拥有1/4日本血统，3/4德国血统。明日香的母亲惣流·今日子·齐柏林（Kyoko Zeppelin Sohryu,从这个名字来看是德日混血，那么明日香的父系血统应是德国人）是NERV德国分部的科学家。在明日香4岁时，·今日子参加了贰号机的搭乘试验（类似碇唯与初号机之间的试验）。试验失败，虽然今日子从这次实验存活下来，但却精神失常，将明日香的娃娃当作是自己的女儿，而拒绝承认明日香是自己的女儿。今日子最后上吊自杀身亡，当时明日香正想将自己获选为EVA驾驶员的好消息告诉母亲时，却发现了母亲的尸体。在妈妈的丧礼上，明日香的祖母向她说她是一位坚强的女孩，但是她不要压抑自己可以尽情的哭泣。然而明日香不同意这个提议，并且说从现在开始她必须照顾自己。从这一天开始，她向自己约定：她不会再哭了。EVA研究站Http://www.cnnerv.com
明日香的父亲很少被提及，在动画中今日子自杀后，明日香的父亲与当时负责照顾明日香的德国医生结婚。她的继母立刻感觉到了明日香的防卫心理，而且无法被她所喜爱。在第二十二话中明日香向碇真嗣提及自己的继母，她说她并不讨厌继母，但是她不会让继母取代她真正母亲。 而在漫画版中，明日香是试管婴儿，因为她的父母无法怀孕，而且后来也因故离异。今日子决定进行人工授精并因此生下明日香，明日香的父系血统来自一位著名的科学家。明日香曾经告诉碇真嗣：“我是由优秀精子与卵子结合而诞生的，我是被挑选出来的人，一个特别的人”。
这样的家庭环境中使明日香一直有很深的心理创伤，与真嗣不同的是，她选择用高傲和自尊来伪装自己脆弱的内心，在睡梦中才会流露出自己软弱的一面（见第九话）。在故事后期明日香的骄傲被使徒和真嗣粉碎后，精神也承受不住打击濒临崩溃。
但在剧场版《The End Of Evangelion》以及漫画版中，明日香在贰号机中感到了母亲的温暖，或许是贰号机启动试验中今日子的部分灵魂融合进了贰号机吧。明日香因此觉醒，驾驶贰号机大战EVA量产型，打出了EVA中极精彩的一幕。
