2008年
MAGI基础理论完成。
律子进入GEHIRN，美理也进入GEHIRN德国分部。律子看见母亲和源渡私通。
明日香成为第二适任者，明日香正想把此消息告知其母亲京子，京子上吊身亡。
2010年
天顶都市初步完成。
直子将MAGI的运作原理告诉女儿律子
直子由绫波零口中得知源渡的真正图谋只是为了要直子完成MAGI而与她私通，恼怒的直子掐死第一个绫波零之后慌张自杀身亡，之后GEHIRN改名特务机关NERV。
2012年
在参拜母亲的陵墓时，真嗣在其父的面前逃离出走。自此以后一直到2015年真嗣都未曾和源堂见过一面。
2014年
绫波零被选为第一适任者，居往第三新东京市。进入市立第一中学就读。
明日香于德国完成大学学业。
EVA零号机、初号机、贰号机此时均已建造完成。
2015年
■ 六月
某日零号机进行连动实验失控，零身受重伤。 （详情见第一话、第二话 ）
某日下午十二时三十分，第三使徒来袭，真嗣同时抵达第三心东京市，使徒来袭同日午夜真嗣驾驶初号机，出现暴走状态，以压倒性战力打败第三使徒，最后使徒与初号机自爆但没有将初号机炸掉，初号机中度破损。
美理正式成为真嗣的监护人，并且将真嗣接到家中同住，自此时起真嗣转入市立第一中学就读。
■ 七月
上旬，第四使徒来袭，被初号机歼灭。
真嗣离家出走，及后被谍报部寻回。 （详情见第三话 ）
■ 八月
月初某日上午九时左右NERV研究第四使徒，但结果亦没有公布。 （详情见第四话）
某日下午二时左右零号机进行第三次连动实验，实验成功。
同日下午2时左右第5使徒在空中出现，并以加粒子砲击败初号机。
同日下午2时左右，使徒放出直径17.5之钢钻自都市0区入侵NERV。
美里提出一点突破法，受司令批准。MAGI表示胜率8.7%。
同日3时，美里向战自研商借改造阳电子砲，并向日本政府徵调全国电力
狙击地点为二子山山顶，名称为「屋岛作战」
日本政府宣报全国晚上11时30分至明天凌晨大停电。
翌日0时00分，作战开始。
零号机大破。
同日0时07分左右，初号机用阳电子炮成功贯穿使徒核心一点，作战成功。
零向真嗣露出第一次笑容
同日0时06左右分使徒钻穿22层防禦板。入侵NERV。
（详情见第五话）
某周三，Jet Alone完成发表纪念会。
纪念会中JA失控往厚木方向前进，核心面临融解的危机。机体自行停止机率0.00002%。
同日美里调动F型装备的初号机助其入内，欲取消JA的密码，但在核心即将融解之际，系统恢复正常，JA沉默。
（详情见第七话）
二十八日
太平洋舰队上，舰队上运载贰号机与ADAM，明日香登场，美里旧男友加持登场。
同日下午第6使徒来袭，联合国太平洋舰队损失3分1的战舰，被战舰以零距离消灭。贰号机则刷新同步记录。
加持则已经预先带同ADAM乘坐YAK 38改战机离开。
二十九日
明日香进入市立第1中学2年A班就读。
（详情见第八话）
■ 九月
五日上午十时三十三分，初次拥有合体分离能力的第7使徒来袭。开始被贰号机一棍切离，使徒居然一分为二，十时五十八分十五秒两机被分离使徒甲、乙打败。上午十一时五分国连空军利用N^2地雷炸毁使徒甲表面物质28.00102289%及使徒乙表面物质27.99589782%，使徒停止活动6天。
隔日明日香搬进美里家与真嗣进行配合特训。但至9月8日方与真嗣开始「正式」进行特训3天。
十一日上午初、贰两机同时重击使徒两个核心，消灭使徒。
（详情见第九话）
九月下旬，NERV在浅间火山口发现第八使徒，发布A-17训令，原想捕捉样本，但使徒在捕捉过程孵化，由D型装备贰号机歼灭。
（详情见第十话）
■ 十月
月初某周五，上午时时三时分，零号机改，进行第二次延长活动实验，机体亦复修完毕，涂装改为蓝色。
（详情见第十一话）
月初某周五，NERV本部大停电，第九使徒在旧热海登陆，三部EVA首次同时出动，并于同日击灭使徒。
（详情见第十一话）
中旬，源渡和冬月自南极运送罗基奴斯长枪回本部。
同日，第10使徒在卫星轨道出现。以带AT力场的分体进行攻击，并且具修正落点的学习能力。
美里打算利用三架EVA直接阻止使徒下降，但胜率只有0.00001%。NERV发出D-17训令，疏散第3新东京市半径50公里的市民，包括总部内的非战斗员及D级以下职员。
翌日作战成功，使徒为之消灭。初号机大破。
真嗣第一次受到父亲的讚美。
美里向真嗣说出加入NERV的经过。
（详情见第十二话)
