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EVA新解
简单的说，我认为，NERV经过艰苦的作战战胜所有使徒这件事，实际上是SEELE早已安排好的，NERV总部知道这件事的活人只有碇源渡、冬月两个（加持在死前应该也知道了，只是不知他有没有把全盘计划告诉美里。）。
我的证据一：源渡的表现。
为什么不管形势多紧急老碇总是稳坐钓鱼台摆他那个烂POSE呢？多半是他早知道不会有危险。如果你要解释成临危不惧的话，请看一下他在使徒“雨”来袭时的表现，为什么只有那一次他离开了控制台，身体力行的去参与EVA的启动呢？显然，当时的停电是外人（似乎是加持OR加持的同党。）造成的，不在“剧本”之中，因此他才会表现出紧张。还有，就是使徒“空”（就是从空中砸下来的那大眼睛，我没记错名字吧……）来袭的时候，他和冬月为什么未卜先知的逃到南极去了呢？显然，“剧本”上说这次要NERV全员撤离，并摧毁NERV基地。但是他们没有预料到美里竟然发动了成功率极低的作战，并取得了成功。
我的证据二：十七使徒
渚熏是由SEELE直接送来的，这一点非常难解释。既然SEELE控制了十七使徒，为什么不能控制其他的使徒呢？我认为，其他的使徒其实也是被SEELE投放到不同的环境中，成长之后才来攻击NERV的。
我的证据三：第三新东京的选址
为什么迎击使徒要专门建造一座城市呢？如果要迎击使徒的话，其实大可以把LILTH弄到撒哈拉去，上面再盖一座NERV总部，然后来了使徒就用N2爆雷扔它（既然使徒“音乐”被一颗N2融化了28%，那四颗呢？而且我们还有核武器，特别是对生物杀伤力很强的中子弹。）。建在这里其实是有其他目的的，我在下面会试着解释。
那么，如此说来，这只不过是一出“EVA战胜使徒”的闹剧罢了，SEELE的目的到底何在？
推测目的一：骗取资金
修复初号机和零号机的损伤所花的钱足以让一个国家垮台，SEELE再有钱也绝无法靠自己的力量建设EVA量产机。因此，不断来袭的使徒就成了在国联骗取大量资金的借口。就连毁掉NERV总部都会成为很好的骗钱理由（见刚才所述，使徒“空”的来袭）。就是因为这样，他们才有大量的资金建设EVA。
推测目的二：掩人耳目
实行人类补完计划就要建造EVA，四十米高的巨人一造就是十几台，如果在地面修建的话不可能不被发现，这也是为什么研究要转移到天然形成的地下空间。这也就说明了第三新东京的选址，而城市是解决NERV大量员工极其家属的安置问题。同时，使徒来袭也成为了EVA名正言顺的存在的理由。为此，SEELE下了苦工封杀具有相似作用的JA。
推测其根本目的：人类补完
人类补完对SEELE到底有什么好处？如果把他们解释成一群狂热的邪教份子，苦心积虑的想要人类进化也未尝不可。但我觉得，他们的目的是为了控制人类融合之后的“集体智慧”，大家是否知道蜜蜂或者蚂蚁的“集体智慧”呢？那么小的昆虫多了以后也会变的让人惊叹的聪明，何况是人类呢？为此，他们试图控制即将成为人类新纪元的“神”——REI。他们的做法就是把LILTH的灵魂存入REI体内，并控制REI。而老碇和冬月（应该还有碇唯）则将唯的灵魂融入到REI的身体里使之与LILTH的灵魂共存。往好了想可以理解为他们希望补完后的人类可以自由的活着。想的庸俗一点则可以说他们想争夺“集体智慧”的占有权。不过，反正上面这些人都失败了，伟大的REI选择了自己的道路（我想可以解释为她生成了自己的灵魂，这也就解释了老碇被补完之前眼前出现了三个REI。我想那应该分别代表三个不同的灵魂。）。
“剧本”的变数
如果连剧中人物都一早知道了戏要如何发展那岂不是太无聊了吗？因此，剧本并没有完全按照SEELE规划的发展，我们的主人公碇真嗣改变了剧本。首先，实验中零号机暴走并伤到了REI这一点是“剧本”中没有的，因此老碇不得已起用了候补人选小碇。自此开始，他们两父子就在有意（老碇）无意（小碇）间争夺着REI的心，REI最终选择了小碇，因此剧场版中拒绝了老碇的命令自发的与LILTH融合，成为了真正（这里的真正指的是她不受别人控制。）的女神。还有，加持同志也或多或少的影响了剧情，本来，在使徒“力”来袭之前老碇已经成功的用“三号机事件”气走了小碇，但加持的一番话（和西瓜）终于让他又回到了初号机驾驶室（并间接引发了EVANGELION中最大的BUG——顺水漂流的战斗服）。
补充一：SEELE如何击败ADAM和LILTH以及“人类无法消灭使徒”的预言
这一点本来很难解释，现在看来，他们很显然使用了核武器（把南极搞的一团糟）。但是，他们并没有消灭第一和第二使徒，而是取得了它们的细胞并进行人工培育，亚当变成胚胎大小后就被封在树脂里，而LILTH则继续成长，至于使徒则是在被捕获之后才生下的，当然也就被SEELE所利用了。
“人类无法消灭使徒，所以才用亚当的细胞制造了夏娃（EVA似乎是德文夏娃的意思，英文是EVE……）”这句话似乎是剧场版中出现的（我为了普及EVA的事业，把我的VCD借给别人了，现在无法求证，完全是靠记忆力。），解迷书中也有提到，这句预言好像出自《死海文书》，不过，它多半是SEELE骗钱的筹码吧？（而事实上，人类也的确没有彻底消灭使徒，最后反而被使徒消灭了……这不知是一个讽刺，还是《死海文书》的预言本来就意有所指呢？说不定，SEELE和老碇他们所有的勾心斗角，根本不过是为人类补完创造舞台，他们自己早已被利用了，这就叫人算不如天算啊。）
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从没在网上发过贴的我也算个新人了，分析有不严密的地方请大家不吝赐教。