第二使徒的身份长期没有定论，最早确认“第二使徒是莉莉丝”的是2003年末的PS2游戏EVA2，由于该游戏被GAINAX官方所认可，第二使徒被认定为莉莉丝。之后出版的官方解惑书籍《Evangelion Chronicle》也确认了这一设定。
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EVA量产机只在剧场版EOE中登场，共生产了九架，不需要驾驶员。
量产机涂装为白色，量产机的物理构造和之前的EVA不同，胸部和肩部更窄嘴部更宽，装甲（或者说拘束具）明显少了许多，动作似乎也因为如此而更为流畅。
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EVANGELION肆号机（EVA04／エウンゲリオン肆号机）基本性能与贰号机相同。与叁号机相反采用白色涂装。在美国的S2机关搭载试验中，与NERV第二支部一块消失。
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EVANGELION叁号机（EVA03／エウンゲリオン叁号机）是基于美国强烈要求之下与肆号机同时制造的福音战士，建造地为在马萨诸塞州的NERV第二支部，外表涂装为黑色，眼睛数目有两颗，血液颜色为红色。TV版驾驶员是第四适格者铃原东治，新剧场版中驾驶员为式波‧明日香‧兰格雷。
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