EVA零号机（EVA00 PROPOTYPE ／エウンゲリオン零号机） 是EVA系列最初开发成功的试作品，驾驶者是第一适格者绫波丽。
零号机的头部设计与之前失败的尝试类似，但为单眼。头部顶端的两枚镜片似乎是为了弥补单眼视觉的不足。最初机体同之前的试用型一样为黄色涂装，外形上与EVA系列其它几机不同之处是两肩没有用于装备武器的突出物体，但在与第五使徒雷天使的战斗中盔甲受损。修复后称作零号机改，涂装改为蓝色并在肩部装甲追加吸附翼和高振动粒子刀，外形除头部之外与EVA贰号机无差异。
因为其试验型的身份令其的配备较初号机及贰号机差，所以零号机在战斗中多是担任后援的角色。在故事第23话中丽为了保护EVA初号机中的真嗣，启动了自爆程序，零号机与第十六使徒一起消失。
零号机中的灵魂一直是不解之谜。虽然丽可以和零号机同步，但TV版一直没有出现与零号机灵魂有关系的资料，唯一的提示是零号机两次暴走中的行动及律子的说话。现时比较流行的说法分别是赤木直子说，碇唯说及无魂说。当中无魂说能解释比较多的疑团，但没有灵魂的EVA能否启动却成为了障碍。
在新剧场版中有登场，而且一直保持黄色的涂装。
