第十五话：谎言与沉默（嘘と沈黙）
加持在京都的废屋里与一个奇怪的女性接触，原来他是一位双面间谍，现在正在调查NERV的附属机关——负责选拔适格者的马尔杜克机关的情况。结果发现该机关名下的公司总共有108家，但其中107家都是空头公司，这是否意味着适格者的选拔有相当的隐情呢？
NERV众人迎来了难得的休息日，真嗣和源度一起去为母亲唯扫墓，明日香为了成全好友光，不情愿地去应付约会，而美里和律子则去参加同学的婚礼。在婚礼结束后，美里因为喝得大醉，加持送她回家。路上，美里向加持吐露了自己的心声，自嘲般哭着诉说了自己的虚伪和脆弱。加持用热吻让美里平静了下来。此时，在家里觉得无聊的明日香也拉住真嗣尝试接吻……
第二天，美里当场逮住了正在NERV核心进行侦查的加持。加持用ID卡打开了最终教条的大门，展现在美里眼前的是被加持称为亚当的白色巨人……
